Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NLKQ9UBE8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms