Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms