Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCMF1Q9P0J7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms