Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GDE1Q9NZC3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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