Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf78Q9NZ63 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf78Q9NZ63 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms