Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DNAJC28Q9NX36 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms