Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLIMQ9NVW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLIMQ9NVW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms