Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms