Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms