Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FANCFQ9NPI8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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