Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1Q9HCU9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms