Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMURF2Q9HAU4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms