Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms