Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms