Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms