Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms