Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATA5Q9BWX5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms