Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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