Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFHD1Q9BUP0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms