Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR3CQ9BUI4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3CQ9BUI4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms