Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCM2Q9BSQ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms