Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM29Q9BSF4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms