Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms