Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORT1Q99523 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms