Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DCLRE1CQ96SD1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms