Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDC1Q96MU7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms