Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms