Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED3Q96IU2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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