Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms