Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms