Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCSTNQ92542 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms