Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms