Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SELENOMQ8WWX9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SELENOMQ8WWX9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms