Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX29Q8TEQ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms