Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNPRQ8TBG9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms