Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms