Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIBP1Q86W92 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms