Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms