Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9AQ7Z3C6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms