Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM179Q6ZVK1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms