Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms