Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms