Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT80Q6KB66 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms