Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms