Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF20Q5VTR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms