Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms