Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM164Q5U3C3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms