Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLVS2Q5SYC1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLVS2Q5SYC1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLVS2Q5SYC1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLVS2Q5SYC1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms