Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LDLRAP1Q5SW96 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms