Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms